Senior Bioinformatics
Your responsibilities:
- Scientific pipeline development
technologies used: R/Python + nextflow + docker / singularity, HPC - Various scenarios: either designing the algorithm from scratch (in tight collaboration with stakeholders) or taking stakeholder’s algorithm and productionalizing it (i.e. turning it from a rough script/draft to a robust, tested, performant pipeline)
- R/Python package development
- Code review for other team members
- Data integration pipelines – i.e. a stakeholder requests a report that would answer a specific set of questions based on data already present and third party databases – our tasks here involve data extraction from databases, transformation, and rendering of an HTML report
- Maintaining CI/CD
- Facilitating meetings (occasionally – cross-team, internal or stakeholder meetings)
- Gathering and refining requirements from stakeholders and other teams
We are looking for you, if you have:
- Minimum 4 years of experience in coding in R
- Experience in developing R packages
- Very good knowledge of Shiny
- Very good knowledge of plotly, ggplot packages
- Good knowledge of using version system control (Git)
- Good knowledge of bash command line and Unix environment
- Knowledge of using Docker
- Knowledge of HTML, JavaScript, jQuery and CSS
- Knowledge of mongoDB, SQL is a plus
- Knowledge of unit testing is a plus
- English at least at B2 level
- Good understanding of biological concepts and experimental methods commonly used in molecular biology and interest to learn more
- Experience with Bioconductor libraries
- Experience with sequencing/genomic data analysis (NGS, e.g. RNA-Seq, WGS, scRNA-Seq) and familiarity with bioinformatics tools used to process such data
- Good knowledge of unit testing and front-end testing (i.e. R/Selenium, phantomjs)
Skillset:
- 4+ years of professional experience in R or Python development
- Experience with communication across teams with different backgrounds (e.g. tech – non-tech, backend – frontend)
- Python / R package development
- Good knowledge of: bash, linux
- Experience with git and git workflows
- Test Driven Development, good coding practices
- CI/CD tools (gitlab CI/CD, Jenkins)
- Containerization (docker)
- Relational databases (PostgreSQL)
- Experience in collaborative coding (working concurrently with other team members on the same codebase, code review & feedback system)
- Communication skills
Nice to have:
- Nextflow
- Genomics-related analyses or other biological data analysis
- Biological (or related) educational background
- Working in an Agile team (we are using kanban)
- Cloud solutions (AWS)
- Apache Spark
- HPC
- Non-relational databases
We offer:
- Participation in interesting and demanding projects
- Flexible working hours
- A great, non-corporate atmosphere
- Stable employment conditions (contract of employment or B2B contract)
- Opportunities for development and promotion
- Attractive package of benefits
- Remote work
We reserve the right to contact the selected candidates.
Dlaczego warto
dołączyć do TTMS?
Elastyczne godziny pracy
Nie każdemu odpowiada praca w firmie w standardowych godzinach 9-17. Od wielu lat z powodzeniem prowadzimy projekty, mimo niejednolitego trybu pracy.
Możliwość pracy zdalnej
W TTMS praca „biurko w biurko” nas napędza, ale rozumiemy, jeśli ktoś woli model zdalny bądź hybrydowy. Jesteśmy wyposażeni we wszystkie konieczne narzędzia, aby pracę wykonywać w dowolnym modelu.
Świetna, niekorporacyjna atmosfera
Profesjonalizm, dbałość o jakość pracy i przyjazna, nieformalna atmosfera nie wykluczają się. Płaska struktura oraz naturalne, życzliwe relacje tworzą u nas podłoże do kreatywności i innowacji.
Ciekawe, międzynarodowe projekty
Tworzymy rozwiązania dla średnich i dużych firm, jesteśmy obecni w Polsce, Malezji, Danii, UK, Szwajcarii i Indiach – efekty Twojej pracy okrążą cały świat. W TTMS masz wpływ na sukces firmy.
Wspólnie ku neutralności klimatycznej
Wybieramy podwykonawców pod kątem minimalizacji śladu węglowego, organizujemy nasadzenia krzewów, ratujemy torfowiska – wszystko po to, żeby osiągnąć neutralność klimatyczną już w 2025 roku. Cieszymy się, że przyciągamy coraz więcej osób, które dbają o zrównoważony rozwój i ochronę środowiska.
Przyjazne biura
Nasze biura to nowoczesne przestrzenie, inspirujące pracowników i przyjazne środowisku. Białystok jest królestwem superbohaterów Marvela, Kraków kojącym lasem tropikalnym, Wrocław galerią sztuki, a oddział Lubelski to rockowe “hall of fame”.
Chciałbyś dla nas pracować?
Przesłanie CV
Zawrzyj w nim informacje o umiejętnościach technicznych, znajomości języków programowania i narzędzi IT. Doświadczenie w projektach mile widziane.
Phone screening
Rozmowa ma na celu ocenę dopasowania kandydata do stanowiska i weryfikację podstawowych informacji z CV. Jest to również okazja do omówienia oczekiwań kandydata oraz krótkiego przedstawienia opisu stanowiska i warunków pracy.
Spotkanie z HR + weryfikacja
Rozmawiamy o doświadczeniach zawodowych kandydata, ale też o oczekiwaniach względem nowej pracy. Jest to moment na sprawdzenie referencji oraz potwierdzenie autentyczności podanych informacji. Pozwala to na lepszą ocenę kompetencji kandydata i jego dopasowania do kultury organizacyjnej firmy.
Rekomendacja do klienta
Kandydat jest przedstawiany klientowi. Etap ten ma na celu dopasowanie przyszłego pracownika do konkretnego projektu, biorąc pod uwagę zarówno umiejętności techniczne, jak i preferencje projektowe, co zwiększa szanse na pomyślną współpracę.
Zatrudnienie
Podpisujemy umowę, w której zawarte są warunki współpracy, zakres obowiązków, wynagrodzenie oraz inne kluczowe aspekty zatrudnienia, takie jak prawa i obowiązki obu stron. Od tej pory kandydat staje się oficjalnym pracownikiem firmy.
Onboarding + pierwszy dzień pracy
Kompleksowy proces zapoznawania nowego pracownika z organizacją, zespołem i narzędziami, w celu jak najszybszego i najefektywniejszego włączenia się do pracy. W TTMS proces ten jest nowoczesny – onboarding prowadzimy poprzez własną platformę e-learningową.
Nasze biura
Warszawa
Serce naszej firmy i centrum dowodzenia.
Funkcjonuje tu Zarząd spółki oraz kierownictwo poszczególnych obszarów biznesowych. To tutaj na co dzień podejmowane są najważniejsze decyzje strategiczne i biznesowe, ale też inicjatywy proekologiczne. Warszawski oddział – zlokalizowany w Varso Tower – stawia sobie za cel stworzenie w pełni ekologicznego biura wykorzystującego Energię odnawialną i stworzonego z materiałów przyjaznych dla środowiska.
Kraków
Poznań
Wrocław
Lublin
Białystok
Łódź
Koszalin
Transition Technologies MS S.A.
(„TTMS”) to szybko rosnący dostawca nowoczesnego outsourcingu IT
w Polsce i zagranicą.
Transition Technologies MS S.A.(„TTMS”) to szybko rosnący dostawca nowoczesnego outsourcingu IT w Polsce i zagranicą. TTMS jest częścią Grupy Transition Technologies, jednej z największych firm branży IT w Polsce, dzięki czemu jesteśmy stabilni i elastyczni.
Zatrudniamy ponad 600 specjalistów. Realizujemy nietypowe, kompleksowe
i nieszablonowe projekty dla wielu branż. Oferujemy elastyczne modele współpracy
i całościową obsługę projektów dzięki zespołom specjalistów z wielu dziedzin.
Stawiamy na ekologię i nieustannie zmniejszamy ślad węglowy, minimalizując jego
negatywny wpływ na środowisko.